Il 99Molibdeno è prodotto attualmente al 99% da cinque reattori, di cui uno, canadese, è al momento fermo.
Come saprai il 99Mo non è usato direttamente in medicina. Viene usato nel "Generatore Molibdeno-Tecnezio" per produrre 99Tc che è uno dei traccianti più usati in medicina nucleare.
Il 99Tc è in fase di sostituzione con 94Tc e 82Rb, entrambi prodotti con ciclotroni.

http://lem.ch.unito.it/didattica/infochi...tc_94.html
http://www.diggita.it/story.php?title=Nu...i_medici-1

Ci sono altri radionuclidi che al momento possono sole essere prodotti in reattori. Ma sono piccoli reattori creati allo scopo, non sono centrali.

Inoltre negli ultimi anni per ragioni di costo e di sicurezza degli impianti, molti radioisotopi prodotti da reattori sono stati sostituiti da equivalenti prodotti da ciclotroni.  

http://www-3.unipv.it/cylena/Tesi/Depaoli.pdf